CD Genomics Blog (Magyar)

mi a 16S rRNA

16S rRNA (16S riboszomális RNS), a prokarióta riboszóma 30S alegység egyik összetevője. A 16-os” S ” egy ülepedési együttható, vagyis egy index, amely tükrözi a makromolekula lefelé irányuló sebességét a centrifugális mezőben. Minél nagyobb az érték, annál nagyobb a molekula. A 16S rRNA gén az rRNA kódoló baktériumoknak megfelelő DNS-szekvencia, amely az összes baktérium genomjában létezik. A 16S rRNA erősen konzervált és specifikus, és a génszekvencia elég hosszú.,

A karakterek 16S rrns

A 16S rrns egy ribosomal RNS szintézis szükséges minden prokarióta fehérjék, az alábbi jellemzőkkel:

Több példány

Minden baktériumot tartalmaz 5~10 példányban 16S rrns, ami az érzékenység erősen.

Multi information

a 16S rRNA gén belső szerkezete változó régiókból és konzervált régiókból áll., A megőrzött területet az összes baktérium osztja meg, a változó régiók különböző fokú különbséggel rendelkeznek a különböző baktériumok között, a nemzetség vagy faj specifikusságával, a változó régiók és a konzervatív területek pedig összefonódnak. Ezért a különböző baktériumok univerzális alapozóit a konzervatív területnek megfelelően lehet megtervezni, a specifikus baktériumok specifikus alapozóit vagy szondáit pedig a változó területnek megfelelően lehet megtervezni. A 16S rRNA változó régióiban található információk interspecifikus különbségei az észlelést specifikussá teszik.,

a hossz mérsékelt

a 16S rRNA kódoló gén hossza körülbelül 1500bp, amely körülbelül 50 funkcionális domaint tartalmaz.

a 16S rRNA

16S rRNA funkciói számos funkcióval rendelkeznek:

① a riboszomális fehérjék immobilizálása állványként működik.

②3 ‘ end tartalmaz egy fordított SD-szekvenciát, amelyet az mRNS augusztus kezdő kodonjához kötnek. A 16S rRNA 3 ‘ End és S1 és S21 kombinációja a fehérjeszintézis megkezdéséhez kapcsolódott.

③ kölcsönhatásba lép a 23-asokkal, hogy segítsen két riboszóma egység integrálásában., (50+30)

16S rrns gén kimutatása

a megjelenése a PCR technológia, valamint a folyamatos fejlesztés, a nukleinsav-kutatás, technológia, 16S rrns gén kimutatása technológia vált egy hatékony eszköz a kórokozó kimutatása, azonosítása. Az adatbázis folyamatos fejlesztésével a technológia alkalmazható a kórokozók gyors, pontos és pontos osztályozására, azonosítására és kimutatására., A technológiának három fő lépése van: először a genomikus DNS megszerzése, a második a 16S rRNA génfragmentum megszerzése, végül a 16S rRNA génszekvencia elemzése.

16S rRNA szekvencia analízis

a 16S rRNA szekvencia-analízis technikájának alapelve a 16S rRNA szekvencia-információ megszerzése a 16S-ból?, RRNA gén fragmentum a mikroorganizmus minta klónozás, szekvenálás vagy enzim vágás és szonda hibridizáció, majd összehasonlítva a szekvencia adatok vagy egyéb adatok a 16S rRNA adatbázis meghatározni a helyzetét az evolúciós fa, így azonosítva a lehetséges mintákat. A létező mikrobák fajai.,

16S rrns gén kimutatása

A típusú 16S rrns szekvencia analízis

Az elemzési módszer a 16S rrns gén töredék elsősorban tartalmazza az alábbi 3 féle:

(1) Szekvenálás a PCR termékek a plazmid vektor, majd összehasonlítani a sorrend a 16S rrns adatbázis meghatározni a helyét az evolúciós fa azonosítani a lehetséges faj mikroorganizmus a minta., Az ezzel a módszerrel kapott információk a legátfogóbbak, de a mintában a komplex szekvenálás kiterjedt szekvenálást igényel.

(2) a PCR termékeket 16S rRNA specifikus szondákkal Hibridizálja a mikrobiális összetételre vonatkozó információk megszerzése érdekében. Ezenkívül a szonda közvetlenül kimutatható in situ hibridizációval a mintával. In situ hibridizáció nem csak meghatározni a morfológiai jellemzői, bősége mikrobák, hanem elemezni a térbeli eloszlását.

(3) a PCR-termékek restrikciós fragmentumhossz polimorfizmus-elemzését végeztük., A ribóz típusú mikroorganizmus gént a vágott elektroforézis atlasz enzim megfigyelésével és numerikus analízissel határoztuk meg, majd összehasonlítottuk a riboszóma könyvtár adataival, valamint elemeztük a minták mikrobiális összetétele és a különböző mikroorganizmusok fajai közötti összefüggést.

alkalmazása 16S rRNA

16S rRNA a legkonzervatívabb gén minden baktérium, és néhány a legkonzervatívabb gének az evolúciós folyamat. A génszekvenciák egy része stabil marad az evolúció hosszú folyamatában., Ezenkívül a bakteriális kromoszómák több példánya alapján, a 16S rRNA gén alapján, a PCR, beágyazott PCR, több félig beágyazott PCR, RT-PCR és oligoszacharidok jönnek létre. Nukleotidszondákat alkalmaztak a klinikai baktériumok azonosítására, szekvenciaelemzésre, a baktériumok molekuláris osztályozására és filogenetikai elemzésre.

a jövőben a 16S rRNA

riboszomális rRNA elengedhetetlen a túlélés minden élőlény. A 16 S rRNA erősen konzervált a baktériumok és más mikroorganizmusok evolúciós folyamatában., A baktériumok “molekuláris fosszilis” – nak nevezik. Ugyanakkor konzervativizmusa relatív. A konzervatív területek között 9-10 variációs régió (V1 ~ V10) van. Különböző fokú különbség van a különböző baktériumok családjaiban, nemzetségeiben és fajaiban, így a 16S rRNA használható mind a bakteriális osztályozás markereként, mind pedig a klinikai kórokozók kimutatására és azonosítására szolgáló célmolekulaként., A PCR a bakteriális riboszóma 16S rrns gén, mint a cél molekula lehet bíró a létezését bakteriális fertőzés korai azonosítani a fajt a kórokozó által további elemzése az erősített termékek teszik ki a fenti hiányosságok. A fertőző betegségek diagnosztizálásában fontos szerepet játszik, hogy itthon és külföldön is a bakteriológusok közé tartozik. Az egyik irányt tanulmányozni kell.

Vélemény, hozzászólás?

Az email címet nem tesszük közzé. A kötelező mezőket * karakterrel jelöltük